Jmol

Jmol est un visualisateur de molécule écrit en Java. A l’origine créé pour remplacer un logiciel propriétaire, XMol, qui n’a plus été maintenu, JMol a pour but d’être une interface ouverte de visualisation de molécule libre, ce qui empêchera son abandon à long terme si les développeurs originels venaient à arrêter. Il intègre depuis le projet global OpenScience visant à créer des logiciels libres à but scientifique, et ambitionne de remplacer la solution propriétaire chime.

Son interface très simple permet de l’utiliser avec des élèves de collège ou de lycée, mais c’est aussi un produit très complet utilisé par un certain nombre d’écoles et d’universités, ainsi que par le département de chimie de l’université d’Oxford. En effet, il a comme avantages :

d’être à la fois une application autonome et applet pour page Web ;
d’avoir un affichage 3D très rapide, même pour de très grosses molécules ;
de supporter de nombreux formats de fichiers dont les classiques .pdb, .mol et .xyz, mais aussi de nombreux autres ;
d’utiliser un langage de script Rasmol/Chime pour les animations ;
de permettre l’affichage des molécules en couleurs 24 bits ;
d’obtenir de meilleures performances des dessins.

La dernière version apporte une cinquantaine( !) de changements et améliorations, aussi n’en listerons-nous que quelques-unes [1] :

la possibilité de "voler" à travers la molecule en mode navigation,
le chargement de plusieurs fichiers à la fois,
la possibilité de manipuler un atome à sa convenance (rotation, translation, inversion)
l’écriture des données de surface Jmol Voxel directement dans les fichiers.

Il faut aussi ajouter que le site propose une documentation en français, et tout ceci en fait un très bon remplaçant au plug-in propriétaire chime.

Site officiel et téléchargement

[1] d’autant plus que nous n’avons pas eu non plus cette longue liste

Un installateur pour Windows afin de simplifier l’installation de ce logiciel

Tags:
Ajouter des tags (séparés par des virgules ou des espaces) : Attention: tous les caractères spéciaux sont interdits (sauf le .). Les tags n'apparaîtront qu'au prochain rafraichissement du cache (dans plusieurs heures).

<< Mettre à jour >>
:: lien mort :: orthographe :: nouveauté :: mise à jour ::

Vous souhaitez mettre à jour la notice ? La première chose à faire est de déterminer s'il s'agit d'une mise à jour mineure ou d'une mise à jour majeure .

Mineure : un lien mort, des fautes d'orthographe, un lien à ajouter ou encore une petite précision.

Veuillez renseigner les champs ci dessous :

Votre nom ou pseudo

Paragraphe

Type de modification

Les modifications à apporter*
Majeure : une nouvelle version avec des nouveautés, des changements majeurs.

En cochant cette case, vous allez créer une page sur le wiki afin de mettre à jour la notice.

Mettre la notice de Jmol sur le wiki

<< Poster un message >>
:: question :: précision :: avis :: commentaire :: bug ::

Jmol , le 25 août 2009 par hillel2008 (0 rép.)

> Jmol , le 18 mai 2005 (1 rép.)

> Jmol, au secours , le 28 février 2005 par jef (2 rép.)

Faire un don ? (défiscalisé)

Aidez-nous à atteindre notre objectif de 1080 donateurs récurrents pour assurer notre pérennité et notre développement !

Je soutiens Framasoft
pour 10€/mois

Autres logiciels

Dégooglisons Internet, l’an 2

Les services en ligne de géants tentaculaires comme Google, Apple, Facebook, Amazon ou Microsoft (GAFAM) mettent en danger nos vies numériques.

Pour cette 2e année, nous continuons le défi de vous proposer une alternative Libre, Éthique, Décentralisée et Solidaire à chacun de ces services.

Découvrez notre campagne
« Dégooglisons Internet »